Экспозиция музея-квартиры разделена на три части: коридор, кабинет и комната. Посетители смогут услышать записи документальной хроники о Булгакове и о его жизни на Большой Пироговской, увидеть подлинные предметы, принадлежавшие писателю, его родным и ближайшим друзьям. Одним из центральных экспонатов является письмо Булгакова Правительству СССР, написанное в этой квартире 28 марта 1930 года с просьбой определить его судьбу – либо дать право эмигрировать, либо предоставить возможность работать во МХАТе.
Напомним, что до открытия музея на Большой Пироговской единственным музеем Михаила Булгакова в Москве являлась так называемая «Нехорошая квартира» – коммуналка на Большой Садовой, ставшая прообразом квартиры из романа «Мастер и Маргарита». Как отмечает издание «Московский комсомолец», с квартирой на Большой Пироговской связана светлая полоса в судьбе как Михаила Булгакова, так и Мастера – главного героя легендарного романа:
«…В противовес “нехорошей квартире” эта – как раз хорошая…»